Jon Skeie er utdannet historiker og er bosatt på Nesodden. Han var ansatt som forsker i økonomisk historie ved Handelshøyskolen BI fra 1993 til 2001. Han har forsket på og skrevet om en rekke emner innenfor norsk historie på 1800- og 1900-tallet, med en hovedvekt på boligpolitikkens og bygningsindustriens historie.

Siden 2001 har han vært ansatt av Porsgrunn kommune for å skrive bind 3 av Porsgrunn bys historie (utkom 2007) og av Kristiansand havn KF for å skrive havnas historie (utkom 2009).

Han har de siste årene også vært ansatt av Statsbygg som rådgiver i forbindelse med utarbeiding av landsverneplaner for statens kulturhistoriske eiendommer i en rekke sektorer, blant annet justissektoren og kunnskapssektoren. Skeie har siden 2001 hatt arbeidsplass og institusjonstilknytning som gjesteforsker ved Norsk Lokalhistorisk Institutt i Oslo.